Si una conexión a Internet funciona correctamente, NTP puede determinar y contabilizar los retrasos en la transmisión de paquetes de forma bastante fiable. Sin embargo, si la conexión a internet está al límite de su capacidad, la sincronización horaria puede degradarse significativamente debido a la gran dispersión en los retrasos de transmisión de paquetes. Los motivos pueden ser ataques de piratas informáticos, que no deben dirigirse a su propia red, o nuevos virus que provoquen una gran avalancha de correos electrónicos, como ya ha ocurrido en el pasado. Un servidor NTP propio no puede ser fácilmente comprometido fuera de Internet.